Την απόσυρση και αναδιαμόρφωση του σχεδίου νόμου του Υπουργείου Περιβάλλοντος και Ενέργειας Εκσυγχρονισμός Περιβαλλοντικής Νομοθεσίας', του οποίου έχει τυπικά ολοκληρωθεί η διαβούλευση και έπεται η εισαγωγή στη Βουλή προς ψήφιση, ζητά η Σύγκλητος του Πανεπιστημίου Αιγαίου, με ψήφισμά της. Ειδικότερα το πανεπιστήμιο Αιγαίου εκφράζει τον έντονο προβληματισμό της σχετικά με το σ/ν που όπως επισημαίνει- «προβλέπει κατάργηση επί της ουσίας των διαδικασιών περιβαλλοντικής αδειοδότησης και αλλαγές στο καθεστώς προστασίας των προστατευόμενων περιοχών, σε αντίθεση με τη διεθνή πρακτική και τις αρχές που έχουν τεθεί από τη διεθνή επιστημονική κοινότητα. Επίσης το σ/ν προβλέπει την κατάργηση των Φορέων Διαχείρισης Προστατευόμενων Περιοχών, που αποτελούν τη βάση ενός αποκεντρωμένου συμμετοχικού συστήματος διοίκησης που έχει στελεχωθεί με ειδικούς επιστήμονες μετά από αξιοκρατικές ανοικτές διαδικασίες, και έχει επιτύχει σε μεγάλο βαθμό την λήψη σημαντικών για τη διατήρηση του φυσικού περιβάλλοντος αποφάσεων, με τη μέγιστη κοινωνική συναίνεση. 

Στη θέση αυτού του συστήματος διοίκησης προτείνεται μια κεντρική γραφειοκρατική δομή (ΟΦΥΠΕΚΑ) η οποία θα συντονίζει έναν αριθμό Μονάδων Διαχείρισης Προστατευόμενων Περιοχών περιορισμένων αρμοδιοτήτων και ασαφούς οργάνωσης. 

Οι παραπάνω αλλαγές στην περιβαλλοντική νομοθεσία εκτιμάται ότι θα οδηγήσουν σε υποβάθμιση του φυσικού περιβάλλοντος και σε απώλεια της βιολογικής ποικιλότητας και των φυσικών πόρων που αυτή συνεπάγεται. 

Στη βάση της νέας νομοθεσίας είναι σκόπιμο να διατηρηθεί το υφιστάμενο αποκεντρωμένο σύστημα διοίκησης μέσω των Φορέων Διαχείρισης Προστατευόμενων Περιοχών, το οποίο πρέπει να ενδυναμωθεί και να συνεχίσει να ελέγχεται και να αξιολογείται με βάση τις διεθνείς πρακτικές».